Melanotan-II a une faible solubilité dans l'eau mais présente une bonne solubilité dans les solvants organiques tels que le diméthylsulfoxyde (DMSO) et le N,N-diméthylformamide (DMF).

Dans des applications pratiques, si la dissolution est nécessaire à des fins expérimentales ou thérapeutiques, elle peut d'abord être dissoute dans du DMSO pour préparer une solution mère à haute -concentration, puis diluée avec un tampon approprié (tel qu'une solution saline physiologique ou une solution saline tamponnée au phosphate{{1}). Il faut cependant veiller à contrôler la concentration finale de DMSO-en la maintenant généralement inférieure à 0,1 %-pour éviter les effets toxiques sur les cellules ou l'organisme.

Dans le domaine de l'esthétique, Melanotan-II a attiré une large attention en raison de sa capacité à induire la production de mélanine et à assombrir la peau. De nombreuses études se sont concentrées sur l’évaluation de son efficacité et de sa sécurité en matière de protection solaire et d’utilisation cosmétique.